أنشئت كعمادة شؤون هيئة تدريس وموظفين بموجب الموافقة الملكية على محضر الجلسة السابعة والستين لمجلس التعليم العالي (سابقاً) بالتوجيه البرقي الكريم رقم 8439 وتاريخ 3/2/1433هـ وفي 27/3/1445هـ تم تحويل العمادة إلى الإدارة العامة للموارد البشرية وكان أول عميد سعادة الدكتور / محمد بن علي المشرف، ثم سعادة الدكتور / فرج بن عبدالله الغامدي، ثم سعادة الدكتور / أحمد بن خزيم العياشي، ثم سعادة الدكتور / مفضي بن رطيان الشراري ، ثم سعادة الأستاذ / فرج بن خليف الشمري مدير الإدارة الحالي، وترتبط الإدارة وفقاً للهيكل التنظيمي بوكالة الجامعة، وتتولى الإدارة دور محوري وهام في الجامعة يتمثل في التعاقد مع الكفاءات المتميزة واستقطابها كما انها معنية بتطبيق الأنظمة واللوائح المعمول بها وتعمل على تلبية احتياجات الجامعة من الموارد البشرية وتقديم أفضل الخدمات لمنسوبي الجامعة من خلال عدة إدارات ووحدات  ترتبط بها وهي :

مساعد مدير عام الموارد البشرية 

1. إدارة التطوير الإداري

2. إدارة عمليات الموارد البشرية.

3. إدارة الرواتب والتعويضات.

4. إدارة التواصل الداخلي 

 حظيت الإدارة بأسبقية على مستوى جامعات المملكة بعد أن احتضنت جامعة الحدود الشمالية اللقاء الأول لعمداء شؤون هيئة التدريس والموظفين الذي عقد خلال الفترة من 12/4/1434هـ الى 13/4/1434هـ..